ابزار نوین برای آشکارسازی شبکه‌های پنهان درون سرطان

به گزارش سامانه جامع اطلاعات آزمایشگاهی،پژوهشگران دانشگاه ناوارا در اسپانیا نرم افزار متن باز جدیدی به نامRNACOREXقادر است هزاران مولکول زیستی، از جمله miRNA و mRNA، را به طور هم زمان تحلیل کرده و تعاملات مولکولی مهمی را شناسایی کند که معمولاً در روش های سنتی نادیده گرفته می شوند. این نرم افزار با ترکیب داده های بیان ژن واقعی و اطلاعات معتبر پایگاه های زیستی، شبکه های تنظیمی قابل تفسیر و مرحله به مرحله ای می سازد که به درک بهتر عملکرد تومورها و مکانیسم های پیشرفت سرطان کمک می کند.آزمایش RNACOREXروی داده های سرطان هایی مانند پستان، ریه، روده بزرگ، معده، ملانوما و تومورهای سر و گردن نشان داد که این ابزار می تواند پیش بینی بقا بیماران را با دقتی مشابه مدل های پیشرفته هوش مصنوعی انجام دهد، با این مزیت مهم که برخلاف بسیاری از مدل های «جعبه سیاه»، توضیحات شفاف و قابل درکی از تعاملات مولکولی ارائه می دهد. علاوه بر پیش بینی بقا، این نرم افزار الگوهای مشترک میان انواع مختلف سرطان و مولکول های کلیدی با اهمیت بالینی را نیز شناسایی می کند.RNACOREXبه صورت رایگان و متن باز در GitHub و PyPI در دسترس است و ابزارهای خودکار برای دریافت پایگاه های داده دارد که استفاده از آن را برای مراکز تحقیقاتی آسان می کند. توسعه دهندگان قصد دارند در آینده قابلیت هایی مانند تحلیل مسیرهای زیستی و لایه های جدید تعاملات مولکولی را به آن اضافه کنند. این پروژه نمونه ای از حرکت به سوی پزشکی دقیق و شخصی سازی شده سرطان است که زیست پزشکی، هوش مصنوعی و علم داده را به طور یکپارچه به کار می گیرد.